Na de bouw van de nieuwe Marinehaven te Den Helder door de Bouwdirectie Sluizen en Stuwen in 1949 ressorteerde de Marinehaven onder de Directie Sluizen en Stuwen. In 1976 werd het havencomplex in beheer en onderhoud overgedragen aan Rijkswaterstaat Directie Noord-Holland, in het bijzonder aan de hoofdafdeling Waterhuishouding en Vaarwegen. Door deze directie werd de Dienst Marinehaven te Den Helder ingesteld. Deze dienst was onder meer belast met het verlenen van medewerking aan de samenstelling van de exploitatiebegroting van de haven en van het haventerrein, het uitvoeren van het beheer en onderhoud van de Marinehaven en de daarbij behorende werken, zoals het vastleggen van de infrastructuur en het op diepte houden van het oefenhaventje 'De Mok' op Texel en de spoorweghaven te Den Helder.