De Horn- en Stommeerpolder werd gevormd per 1 januari 1969 door de samenvoeging van de naast elkaar gelegen zelfstandige Hornmeerpolder en Stommeerpolder. Deze zijn gelegen binnen dezelfde ringdijk, en werden slechts gescheiden door een kade op maaihoogte. Ten behoeve van de samengevoegde polders werd een nieuw elektrisch gemaal gebouwd. Na een bestaan van slechts negen jaar ging de nieuwe polder op in het Waterschap Groot Haarlemmermeer. Op 1 januari 1979 trad het nieuwe Waterschap Groot Haarlemmermeer in werking. In dit waterschap werd de Haarlemmermeerpolder samengevoegd met vijftien kleinere polders, waaronder de Horn- en Stommeerpolder.