Wanneer de parochie in Aalsmeer is gesticht is niet bekend. In 1549 kregen de Aalsmeerders een nieuw kerkgebouw. Nadat in de tweede helft van de 16e eeuw het protestantisme de overhand had gekregen, werd vanaf 1580 de uitoefening van de Katholieke eredienst in verscheidenen gewesten verboden. De katholieken van Aalsmeer waren genoodzaakt hun vrij nieuwe kerkgebouw te verlaten en moesten hun toevlucht nemen tot een schuilkerk. In 1653 werd een nieuwe schuilkerk gebouwd. In 1723 vond een scheuring plaats in de katholieke kerkgemeenschap tussen aanhangers van de kerk van Rome en die van de Utrechtse kapittel. De parochie van Aalsmeer behoorde tot de aanhang van de kapittels. Ze werden Jansenisten of Staatskatholieken genoemd, later ook wel aanhangers van de Oud-Bisschoppelijke Clerezij en aan het einde van de 19e eeuw Oud-Katholieken. De kerkscheuring had nagenoeg geen effect op het aantal parochianen, de tand des tijds echter wel. In 1723 schaarden ruim 300 parochianen zich achter hun pastoor, in 1809 was het aantal parochianen gedaald tot 84. In 1983 waren er nog 24 Oud-Katholieken in Aalsmeer.