De taken van de projectdirectie Biobrandstoffen zijn:
het ontwikkelen en coördineren van het beleid gericht op het op de Nederlandse markt brengen van duurzame biobrandstoffen;
het ontwikkelen en voeren van beleid gericht op het verkrijgen van draagvlak voor en op het operationaliseren van duurzaamheidscriteria voor biomassa voor energietoepassingen, waaronder biobrandstoffen;
het voeren van de regie over en het versterken van de externe contacten, het zorg dragen voor externe rapportages over de voortgang en het beantwoorden van kamervragen op het beleidsterrein met betrekking tot biobrandstoffen;
het bij de uitvoering van de in de onderdelen a tot en met c genoemde taken integreren van de nationale, Europese en mondiale schaal van het beleid inzake biobrandstoffen, inclusief de uitvoering daarvan.