Aan het hoofd van de Rijkshavendienst stond een rijkshavenmeester. Hij was belast met het nautisch beheer van de rijkshavens en -vaarwegen. Het was de taak van de Rijkshavendienst om de scheepvaart in die havens en op die vaarwegen optimaal te regelen. In tegenstelling tot het nautisch beheer was een dienstkring van Rijkswaterstaat Directie Noord-Holland belast met het technisch beheer van de havens en vaarwegen.