De Stichting Katholiek Onderwijs Haarlemmerliede is opgericht in 1969 met als doel de bevordering van het basisonderwijs in het tegenwoordige gebied van de gemeente Haarlemmerliede en Spaarnwoude. Zij beoogt om daarbij onderwijs te doen geven in de geest van de R.-K. Kerk. Het doel werd bereikt door het oprichten en beheren van een of meer r.-k. scholen binnen de gemeente Haarlemmerliede en Spaarnwoude. De stichting heeft naast de Sint Franciscusschool te Haarlemmerliede (tot 1993) tevens het eigendom en beheer van de Sint Adalbertusschool en de kleuterschool De Glasaaltjes te Spaarndam. Begin jaren 90 van de 20e eeuw was het leerlingenaantal van de Sint Franciscusschool drastisch gedaald. Het stichtingsbestuur was voor opheffing van de school. De kinderen uit Haarlemmerliede zouden dan in Spaarndam naar school moeten. Er kwam echter veel verzet van het onderwijzend personeel, ouders en inwoners van Haarlemmerliede, gesteund door burgemeester drs. F.J.A. IJsselmuiden en pastor dr. H.C. Laan. Gezamenlijk werd er actie gevoerd met als resultaat dat de Sint Franciscusschool als zelfstandige school behouden bleef. Wel stapte de school in 1993 uit de Stichting Katholiek Onderwijs Haarlemmerliede. In Haarlemmerliede werd op 15 maart 1993 een nieuwe stichting opgericht, de Stichting Rooms Katholiek Onderwijs Sint Franciscus. Tot 1969 functioneerde het kerkbestuur van de Parochie Heilige Jacobus de Meerdere te Haarlemmerliede tevens als schoolbestuur van de Sint Franciscusschool. De school is in 1920 door de parochie opgericht. Tot 1969 is de school ook eigendom van de parochie. Tot 1969 functioneerde het kerkbestuur van de Parochie Sint Adalbertus te Spaarndam tevens als schoolbestuur van de - in 1949 opgerichte - Sint Adalbertusschool te Spaarndam en de - in 1950 opgerichte - Sint Adalbertuskleuterschool. In 1973 is de naam van de kleuterschool veranderd in R.-K. Kleuterschool De Glasaaltjes.