De Stichting Wetenschappelijk Duinonderzoek werd opgericht in 1948 met als doelstelling de bevordering van wetenschappelijk onderzoek van de duinen en de flora. De Hollandsche Maatschappij der Wetenschappen verleende in de beginperiode enkele incidentele subsidies. Met ingang van 1954 ontving de Stichting een structurele subsidie van de Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen.