Het eerste reglement van de Waarderpolder, die in 1562 werd gesticht, dateert van 1845, in welk jaar een algemeen reglement tot het beheer van de Waarder-, Veer-, Zuider-, Romolen- en Poelpolder door het hoogheemraadschap werd vastgesteld. Hoewel al deze polders hetzelfde bestuurshoofd moesten delen in de persoon van de burgemeester van de gemeente Haarlemmerliede, kan toch gesteld worden, dat hiermee de vijf polders als aparte openbare lichamen zijn ontstaan. Elke polder had namelijk een afzonderlijk bestuur. De Waarderpolder was verantwoording verschuldigd aan Gedeputeerde Staten van Noord-Holland, maar bovendien aan het Hoogheemraadschap van Rijnland, waarvan hij deel uitmaakte. Met ingang van 1 januari 1951 hield elke bemoeienis van Rijnland met de Waarderpolder op, maar dit toezicht werd met ingang van 1 januari 1959 hersteld. Een van de taken van het bestuur was, behalve bemaling, onderhoud van de waterstaatswerken en toezicht op de onderhoudsplicht van de ingelanden, het beheer over de wegen. Deze laatste taak kon de polder op den duur niet meer aan en tenslotte moest men dit overlaten aan de gemeente Haarlem, waarbij ook het eigendom werd overgedragen. De aanleg van industriegebied maakte opspuiting noodzakelijk, zodat de Waarderpolder merendeels technisch ontpolderd raakte, waardoor de betekenis van de polder als openbaar lichaam steeds kleiner werd. Uiteindelijk werd de Waarderpolder ook juridisch opgeheven en wel met ingang van 1 januari 1979. Het technisch nog niet ontpolderde gedeelte maakt deel uit van een nieuw gevormd Waterschap Groot-Haarlemmermeer. Dit alles gebeurde bij beschikking van Provinciale Staten van Noord-Holland op 30 oktober 1978. Verder zijn alle taken overgenomen door de gemeente Haarlem, waarvoor de Waarderpolder ook als recreatiegebied betekenis heeft gekregen.