Het bestuur van het Spoorwegpensioenfonds bestaat uit een directie en raad van toezicht. Bij de directie berust het beheer van het fonds en de toepassing van deze wet (spoorwegpensioenwet). De raad van toezicht is belast met het toezicht op de uitvoering van de taak, die aan de directie is opgedragen. Bovendien is een speciale afdeling van de Raad van toezicht belast met de beslissing op bezwaarschriften, welke worden ingediend tegen beslissingen van de directie.