Als stichtingsjaar van de Verenigde Binnenpolder geldt 1859, het jaar waarin de polder een zelfstandig bestuur krijgt en daarmee en waterschap wordt. De naam Verenigde Binnenpolder dateert uit 1813. In dat jaar werd de Binnenpolder onder Houtrijk, of ook wel Noord-Houtrijkerpolder genoemd, gevoegd bij de Binnenpolder onder Hofambacht en Spaarnwoude. Dit hield in dat de bemaling werd overgenomen door de molens van de Binnenpolder onder Haarlemmerliede en Spaarnwoude. De polder lag in 1813 geheel binnen de gemeente Spaarnwoude. Deze gemeente bestuurde de polder. In 1817 werd de gemeente opgeheven, waardoor de polder onder drie gemeenten kwam: Haarlemmerliede en Spaarnwoude, Hofambacht en Houtrijk en Polanen. De waterstaatszaken werden voor Hofambacht door Haarlemmerliede waargenomen. Met Houtrijk bestond een dergelijke overeenkomst niet, zodat twee gemeenten zeggenschap hadden binnen de polder. In 1857 werd Hofambacht bij Haarlemmerliede en Spaarnwoude gevoegd, in 1863 volgden Houtrijk en Polanen. Al in 1837 doet de burgemeester van Haarlemmerliede een verzoek aan het Hoogheemraadschap Rijnland om te komen tot een van de gemeente(n) losstaand waterschapsbestuur. Rijnland stemde hierin echter niet toe, wel kregen in 1845 een aantal andere polders onder de gemeente Haarlemmerliede een dergelijk bestuur. In 1859 waren het tenslotte Provinciale Staten die het mogelijk maakten te komen tot de oprichting van een zelfstandig waterschap. Met ingang van 1 januari 1979 is het waterschap opgeheven en werden haar taken overgenomen door het toen opgerichte waterschap Groot-Haarlemmermeer. Het beheer over de wegen was reeds overgenomen door de gemeente Haarlemmerliede.