De oudste vermelding van de hofstede Leyduin gaat terug tot 1596. In de loop van de tijd werd het landgoed door de verschillende eigenaren uitgebreid en verfraaid. In de 18e eeuw werd Leyduin bewoond door diverse leden van de familie Van Loon. Vervolgens kwam het landgoed in 1808 in het bezit van de familie Van Lennep. Deze familie stelde delen van het terrein beschikbaar voor de eerste duinwaterwinning ten behoeve van Amsterdam. Het huidige huis Leyduin werd in het begin van de 20e eeuw gebouwd en bewoond door A. Dorhout Mees. In de loop van die eeuw kwam Leyduin in handen van de provincie Noord-Holland, sinds 1996 is het landgoed eigendom van de Stichting Landschap Noord-Holland.