Bij de vorming van het vierde kabinet-Colijn in 1937 werd het Ministerie van Algemene Zaken opgericht met de voorzitter van de Ministerraad aan het hoofd. Nadat de regering in mei 1940 naar Londen was uitgeweken ontstonden er twee ministeries van Algemene Zaken, één in bezet gebied en één in Londen. Door de oprichting van het Ministerie voor Algemene Oorlogvoering van het Koninkrijk (AOK) in 1942, dat coördinerend diende op te treden, bleef er voor het Londense Algemene Zaken weinig werk over, maar het bleef officiëel bestaan tot  23 februari 1945.

Tot 9 september was D.J. de Geer minister van Algemene Zaken, daarna was dat H. van Boeijen.