De directie FCI vormt samen met de directie FEZ de financiële functie van het kerndepartement. Binnen de directie FCI zijn de financiële administratie en het inkoopbureau ondergebracht. In de directie zijn eveneens financieel specialisten werkzaam. Zij ondersteunen en adviseren de VROM organisatie op het gebied van financiën en project- en budgetbeheer.