De secretaris-generaal is ambtelijk eindverantwoordelijk voor het functioneren van het ministerie en voor de voorbereiding en uitvoering van het beleid waarvoor de politieke leiding de politieke verantwoordelijkheid draagt.

De secretaris generaal heeft als hoogste ambtenaar tot taak te zorgen voor een goede onderlingen afstemming van de verschillende beleidsterreinen en voor de uitvoering en uitvoerbaarheid van het ontwikkelde beleid.

De secretaris-generaal en de directeuren-generaal vormen samen de bestuursraad (BR), het overlegorgaan van de ambtelijke leiding waarbij de secretaris -generaal als voorzitter fungeert.